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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4yodA_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: thioredoxin-like protein; | PDBTitle: crystal structure of a thioredoxin-like protein (baccac_02376) from2 bacteroides caccae atcc 43185 at 1.90 a resolution |
Added to library: Sat Mar 28 08:22:40 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | I | K | T | F | T | L | P | A | I | P | Q | I | X | V | A | P | E | Q | R | A | E | F | L | V | K | H | Y | W | D | N | V | N | F | A | D | T | N | Y | I | H | H | P | E | I | T | E | Q | A | W | V | D | Y | C | D | I | L | N | H | V | P | L | K | T | A | Q | E | A | I | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | T | I | D | R | T | N | V | D | K | K | V | F | A | Y | I | T | D | L | A | D | K | Y | L | Y | D | P | N | S | P | X | R | N | E | E | F | Y | I | P | V | L | E | A | X | A | A | S | P | V | L | E | E | I | E | K | V | R | P | K | A | R | L | E | L | A | Q | K | N | R | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | T | K | A | I | N | F | T | Y | T | L | A | S | G | A | Q | G | S | L | Y | Q | L | N | A | D | Y | L | L | L | F | I | N | N | P | G | C | H | A | C | T | E | T | I | E | G | L | K | Q | A | P | I | I | S | Q | L | I | K | E | K | K | L | I | V | L | S | I | Y | P | D | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | B | T | T | S | G | G | G | S | S | S | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | E | L | D | D | W | R | K | H | L | N | E | F | P | K | E | W | I | N | G | Y | D | K | K | F | T | I | K | E | K | Q | L | Y | D | L | K | A | I | P | T | L | Y | L | L | N | K | E | K | T | V | L | L | K | D | A | T | T | Q | A | I | E | E | Y | L | X | I | H | Q | |||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | B | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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