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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4yo7A_ | PDB header: solute binding protein | Chain: A: PDB Molecule: sugar abc transporter (sugar-binding protein); | PDBTitle: crystal structure of an abc transporter solute binding protein2 (ipr025997) from bacillus halodurans c-125 (bh2323, target efi-3 511484) with bound myo-inositol |
Added to library: Sat Mar 28 08:57:22 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | G | D | S | G | Q | K | V | I | G | V | S | I | S | N | L | D | E | F | L | T | Y | X | Q | D | A | X | K | E | E | A | A | N | Y | P | D | F | E | F | I | F | S | D | A | Q | N | D | S | T | Q | Q | X | A | Q | V | E | N | F | I | S | R | N | V | D | A | I | I | V | N | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | D | T | T | S | A | V | D | I | V | N | X | V | N | D | A | G | I | P | I | I | I | A | N | R | T | F | D | G | V | D | Q | A | T | A | F | V | G | S | E | S | I | Q | S | G | L | L | Q | X | E | E | V | A | K | L | L | N | N | E | G | N | I | A | I | X | D | G | E | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | T | T | G | G | G | S | S | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | E | A | Q | I | X | R | T | E | G | N | K | Q | I | I | E | E | H | D | G | L | E | V | V | L | Q | G | T | A | K | F | D | R | S | E | G | X | R | L | X | E | N | W | L | N | S | G | T | E | I | D | A | V | V | A | N | N | D | E | X | A | L | G | A | I | L | A | L | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | G | K | L | D | D | V | I | V | A | G | I | D | A | T | P | A | A | L | E | A | X | K | E | G | K | L | D | V | T | V | F | Q | D | A | K | G | Q | G | A | T | S | V | K | V | A | V | Q | A | A | N | G | E | D | V | E | D | A | X | I | P | Y | E | L | V | T | P | E | N | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | B | T | T | B | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | E | Y | E | A | K | Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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