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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4yo0D_ | 1.56 | PDB header: immune system | Chain: D: PDB Molecule: light chain of antigen binding fragment, fab; |
Added to library: Sat Mar 5 09:59:50 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | V | L | T | Q | P | N | S | V | S | T | N | L | G | S | T | V | K | L | S | C | K | R | S | T | G | N | I | G | S | N | Y | V | N | W | Y | Q | Q | H | E | G | R | S | P | T | T | M | I | Y | R | D | D | K | R | P | D | G | V | P | D | R | F | S | G | S | I | D | R | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | B | T | T | T | B | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | S | A | L | L | T | I | N | N | V | Q | T | E | D | E | A | D | Y | F | C | H | S | Y | S | S | G | I | V | F | G | G | G | T | K | L | T | V | L | G | Q | P | K | S | T | P | T | L | T | V | F | P | P | S | T | E | E | L | Q | G | N | K | A | T | L | V | C | L | I | S | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | F | Y | P | S | D | V | E | V | A | W | K | A | N | G | A | P | I | S | Q | G | V | D | T | A | N | P | T | K | Q | G | N | K | Y | I | A | S | S | F | L | R | L | T | A | E | Q | W | R | S | R | N | S | F | T | C | Q | V | T | H | E | G | N | T | V | E | K | S | L | S | P | |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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