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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ynzB_ | PDB header: transferase | Chain: B: PDB Molecule: serine/threonine-protein kinase brsk2; | PDBTitle: structure of the n-terminal domain of sad |
Added to library: Sat Dec 19 09:36:41 2015 | |
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Sequence | G | P | L | G | S | M | Q | Y | V | G | P | Y | R | L | E | K | T | L | G | K | G | Q | T | G | L | V | K | L | G | I | H | C | V | T | C | Q | K | V | A | I | K | I | V | N | R | E | K | L | S | E | S | V | L | M | K | V | E | R | E | I | A | I | L | K | L | I | E | H | P | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | L | K | L | H | D | V | Y | E | N | K | K | Y | L | Y | L | V | L | E | H | V | S | G | G | E | L | F | D | Y | L | V | K | K | G | R | L | T | P | K | E | A | R | K | F | F | R | Q | I | I | S | A | L | D | F | C | H | S | H | S | I | C | H | R | D | L | K | P | E | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | B | S | S | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | L | D | E | R | N | N | I | R | I | A | D | F | G | M | A | S | L | S | P | H | Y | A | C | P | E | V | I | R | G | E | K | Y | D | G | R | K | A | D | V | W | S | C | G | V | I | L | F | A | L | L | V | G | A | L | P | F | D | D | D | N | L | R | Q | L | L | E | K | V | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | G | V | F | H | M | P | H | F | I | P | P | D | C | Q | S | L | L | R | G | M | I | E | V | D | A | A | R | R | L | T | L | E | H | I | Q | K | H | I | W | Y | I | G | G | K | N | E | P | E | P | E | Q | P | I | P | R | K | V | Q | I | R | S | L | P | S | L | E | D | I | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | ||||
Sequence | P | D | V | L | D | S | M | H | S | L | G | C | F | R | D | R | N | K | L | L | Q | D | L | L | S | E | E | E | N | Q | E | K | M | I | Y | F | L | L | L | D | R | K | L | |||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | S | S |
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