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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4yk8A_ | PDB header: protein transport | Chain: A: PDB Molecule: meiotically up-regulated gene 66 protein; | PDBTitle: crystal structure of the atg101-atg13 complex from fission yeast |
Added to library: Sat Jun 6 08:21:57 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | P | H | M | T | N | T | V | T | I | E | L | K | I | G | Y | K | Y | A | A | E | V | V | K | A | V | L | G | V | I | L | F | H | R | Q | F | S | T | V | P | A | R | T | I | D | V | L | D | I | T | V | P | T | L | V | G | A | E | L | N | E | Q | L | A | T | K | A | A | E | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | D | T | I | R | N | E | A | N | G | Q | M | I | L | L | L | Y | E | R | S | P | K | K | S | W | F | G | K | G | N | T | I | P | W | E | Q | W | I | L | H | T | T | I | L | E | E | G | D | S | Y | Q | E | S | S | L | S | L | E | A | A | V | E | Q | I | V | Q | A | V | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | S | L | S | Y | L | P | P | V | A | M | D | S | G | N | Y | P | Y | E | I | V | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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