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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4yhsA_ | PDB header: solute-binding protein | Chain: A: PDB Molecule: monosaccharide abc transporter substrate-binding protein, | PDBTitle: crystal structure of an abc transporter solute binding protein2 (ipr025997) from bradyrhizobium sp. btai1 (bbta_2440, target efi-3 511490) with bound bis-tris |
Added to library: Sat Mar 21 08:48:20 2015 | |
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Sequence | S | X | A | E | W | Y | P | Y | D | A | A | K | I | D | P | P | F | A | A | D | G | K | S | S | D | V | K | Y | V | P | L | E | K | A | S | K | P | W | K | L | C | V | S | F | P | H | X | K | D | A | Y | W | L | G | V | D | Y | G | V | A | E | E | S | K | R | L | G | V | K | X |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | L | V | E | A | G | G | Y | T | E | L | N | K | Q | I | S | Q | I | E | D | C | V | A | S | G | T | D | A | V | I | I | G | A | I | S | A | D | G | L | N | K | V | I | G | E | I | A | K | K | K | I | P | V | I | D | L | V | N | G | I | S | S | P | D | I | A | A | K | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | S | F | Y | T | X | G | A | E | T | G | S | Y | L | A | K | K | H | P | A | G | T | P | E | V | V | V | G | W | F | P | G | P | A | G | A | G | W | V | E | A | A | N | K | G | F | X | D | A | V | K | G | S | A | I | K | V | L | E | P | K | Y | G | D | T | G | K | E | V | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | K | L | V | E | D | A | L | Q | A | A | P | N | I | R | Y | V | A | G | T | A | V | T | A | E | A | A | Q | G | L | I | R | E | R | G | L | K | G | K | V | D | L | L | A | F | Y | X | T | P | G | V | Y | E | G | I | K | R | G | L | I | X | A | A | P | A | D | S | X | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | T | T | B | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | ||
Sequence | Q | G | R | I | A | V | D | Q | A | V | R | I | L | E | G | K | D | Y | V | K | H | V | G | P | K | I | F | V | V | D | S | A | N | I | A | T | V | P | Q | A | N | I | L | P | P | D | G | F | K | P | V | F | N | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | G | G | G | S | G | G | G | T | S | T | T |
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