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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4yh6B_ | PDB header: immune system | Chain: B: PDB Molecule: interleukin-1 receptor accessory protein-like 1; | PDBTitle: crystal structure of il1rapl1 ectodomain |
Added to library: Sat May 9 09:35:36 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | C | T | D | W | D | I | K | K | Y | Q | V | L | V | G | E | P | V | R | I | K | C | A | L | L | A | Q | S | A | G | L | S | L | M | W | Y | K | S | S | G | P | G | D | F | E | E | P | I | A | F | D | G | S | R | M | S | K | E | E | D | S | I | W | F | R | P | T | L | L | Q | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | G | L | Y | A | C | V | I | R | N | S | T | Y | C | M | K | V | S | I | S | L | T | V | G | E | N | D | T | G | L | C | Y | N | S | K | M | K | Y | F | E | K | A | E | L | S | K | S | K | E | I | S | C | R | D | I | E | D | F | L | L | P | T | P | E | I | L | W | Y | K | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | C | R | T | K | A | W | R | P | S | I | V | F | K | R | D | T | L | L | I | K | E | V | K | E | D | D | I | G | N | Y | T | C | E | L | K | Y | G | G | F | V | V | R | R | T | T | E | L | T | V | T | A | P | L | T | D | K | P | P | K | L | L | Y | P | M | E | S | K | L | T | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Q | E | T | Q | L | G | G | S | A | N | L | T | C | R | A | F | F | G | Y | S | V | S | P | L | I | Y | W | M | K | G | E | K | F | I | E | D | L | D | E | N | R | V | W | E | S | D | I | R | I | L | K | E | H | L | G | E | Q | E | V | S | I | S | L | I | V | D | S | V | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | D | L | G | N | Y | S | C | Y | V | E | N | G | N | G | R | R | H | A | S | V | L | L | H | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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