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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ydhC_ | PDB header: signaling protein | Chain: C: PDB Molecule: formin-like protein 1; | PDBTitle: the structure of human fmnl1 n-terminal domains bound to cdc42 |
Added to library: Sat May 16 08:18:44 2015 | |
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Sequence | A | A | G | E | L | E | E | R | F | N | R | A | L | N | C | M | N | L | P | P | D | K | V | Q | L | L | S | Q | Y | D | N | E | K | K | W | E | L | I | C | D | Q | E | R | F | Q | V | K | N | P | P | A | A | Y | I | Q | K | L | K | S | Y | V | D | F | K | R | R | V | Q | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | Q | V | L | R | E | L | E | T | S | L | R | T | N | H | I | G | W | V | Q | E | F | L | N | E | E | N | R | G | L | D | V | L | L | E | Y | L | A | F | A | Q | C | S | V | T | Y | D | M | K | A | L | R | N | S | R | I | V | S | Q | K | D | D | V | H | V | C | I | M | C | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | A | I | M | N | Y | Q | S | G | F | S | L | V | M | N | H | P | A | C | V | N | E | I | A | L | S | L | N | N | K | N | P | R | T | K | A | L | V | L | E | L | L | A | A | V | C | L | V | R | G | G | H | D | I | I | L | A | A | F | D | N | F | K | E | V | C | G | E | Q | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | F | E | K | L | M | E | Y | F | R | N | E | D | S | N | I | D | F | M | V | A | C | M | Q | F | I | N | I | V | V | H | S | V | E | N | M | N | F | R | V | F | L | Q | Y | E | F | T | H | L | G | L | D | L | Y | L | E | R | L | R | L | T | E | S | D | K | L | Q | V | Q | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||
Sequence | Q | A | Y | L | D | N | I | F | D | V | G | A | L | L | E | D | T | E | T | K | N | A | V | L | E | H | M | E | E | L | Q | E | Q | V | A | L | L | T | E | R | L | R | D | A | E | N | E | S | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
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