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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4yd8A_ | PDB header: protein transport | Chain: A: PDB Molecule: protein pthb1; | PDBTitle: bardet-biedl syndrome 9 protein (aa1-407), homo sapiens |
Added to library: Sat Jun 27 08:12:08 2015 | |
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Sequence | L | F | K | A | R | D | W | W | S | T | I | L | G | D | K | E | E | F | D | Q | G | C | L | C | L | A | N | V | D | N | S | G | N | G | Q | D | K | I | I | V | G | S | F | X | G | Y | L | R | I | F | S | P | H | P | A | K | T | G | D | G | A | Q | A | E | D | L | L | L | E | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | L | R | D | P | V | L | Q | V | E | V | G | K | F | V | S | G | T | E | X | L | H | L | A | V | L | H | S | R | K | L | C | V | Y | S | V | S | G | T | L | G | N | Q | C | Q | X | K | L | X | Y | E | H | N | L | Q | R | T | A | C | N | X | T | Y | G | S | F | G | G | V | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | R | D | L | I | C | I | Q | S | X | D | G | X | L | X | V | F | E | Q | E | S | Y | A | F | G | R | F | L | P | G | F | L | L | P | G | P | L | A | Y | S | S | R | T | D | S | F | L | T | V | S | S | C | Q | Q | V | E | S | Y | K | Y | Q | V | L | A | F | A | T | D | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | L | V | V | D | W | T | L | N | I | G | E | Q | A | L | D | I | C | I | V | S | F | S | A | S | S | V | F | V | L | G | E | R | N | F | F | C | L | K | D | N | G | Q | I | R | F | X | K | K | L | D | W | S | P | S | C | F | L | P | Y | C | S | V | S | E | G | T | I | N | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | L | I | G | N | H | N | N | X | L | H | I | Y | Q | D | V | T | L | K | W | A | T | Q | L | P | H | I | P | V | A | V | R | V | G | C | L | H | D | L | K | G | V | I | V | T | L | S | D | D | G | H | L | Q | C | S | Y | L | G | T | D | P | S | L | F | Q | A | P | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T |
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