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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4yc5A_ | 1.76 | PDB header: structural protein | Chain: A: PDB Molecule: beta1; |
Added to library: Sat Mar 12 08:43:28 2016 | |
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Sequence | H | M | N | V | G | E | I | L | R | H | Y | A | A | G | K | R | N | F | Q | H | I | N | L | Q | E | I | E | L | T | N | A | S | L | T | G | A | D | L | S | Y | A | N | L | H | H | A | N | L | S | R | A | N | L | R | S | A | D | L | R | N | A | N | L | S | H | A | N | L | S | G |
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SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | N | L | E | E | A | N | L | E | A | A | N | L | R | G | A | D | L | H | E | A | N | L | S | G | A | D | L | Q | E | A | N | L | T | Q | A | N | L | K | D | A | N | L | S | D | A | N | L | E | Q | A | D | L | A | G | A | D | L | Q | G | A | V | L | D | G | A | N | L | H | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | N | L | N | N | A | N | L | S | E | A | M | L | T | R | A | N | L | E | Q | A | D | L | S | G | A | R | T | T | G | A | R | L | D | D | A | D | L | R | G | A | T | V | D | P | V | L | W | R | T | A | S | L | V | G | A | R | V | D | V | D | Q | A | V | A | F | A | A | A | H |
Predicted secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | B | T | T | B | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T |   | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | G | L | C | L | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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