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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4y68A_ | 2.21 | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: putative nisin-resistance protein; |
Added to library: Sat Jan 23 08:33:40 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | N | I | Y | L | L | P | P | S | S | E | R | Y | G | R | V | I | L | D | R | V | E | Q | R | G | L | Y | S | Q | G | R | Q | W | Q | I | I | R | Q | R | S | E | K | K | L | K | T | S | K | S | Y | Q | E | S | R | N | I | V | Q | E | A | V | R | Y | G | G | G | K | H | S | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | L | S | K | E | T | V | R | R | D | T | L | D | S | R | Y | P | E | Y | R | R | L | N | E | D | I | L | L | I | T | I | P | S | I | S | K | L | D | K | R | S | I | S | H | Y | S | G | K | L | Q | N | I | L | M | E | K | S | Y | K | G | L | I | L | D | L | S | N | N | T | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | B | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | N | M | I | P | M | I | G | G | L | A | S | I | L | P | N | D | T | L | F | H | Y | T | D | K | Y | G | N | K | K | T | I | T | M | K | N | I | P | L | E | A | L | K | I | S | R | K | T | I | N | T | K | H | V | P | I | A | I | I | T | N | H | K | T | A | S | S | A | E | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | G | G | G | S | S | S | T | T | G | G | G | S | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | F | L | S | F | K | G | L | P | N | V | K | S | F | G | Q | A | T | A | G | Y | T | T | V | N | E | T | F | M | L | Y | D | G | A | R | L | A | L | T | T | G | I | V | S | D | R | Q | G | Y | K | Y | E | N | T | P | I | L | P | D | Q | V | T | S | L | P | L | Q | E | S | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | W | L | K | S | R | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
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