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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4xt3A_ | PDB header: viral protein/signalling protein | Chain: A: PDB Molecule: g-protein coupled receptor homolog us28; | PDBTitle: structure of a viral gpcr bound to human chemokine cx3cl1 |
Added to library: Sat Mar 7 08:56:53 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | D | A | T | P | C | V | F | T | D | V | L | N | Q | S | K | P | V | T | L | F | L | Y | G | V | V | F | L | F | G | S | I | G | N | F | L | V | I | F | T | I | T | W | R | R | R | I | Q | C | S | G | D | V | Y | F | I | N | L | A | A | A | D | L | L | F | V | C | T | L | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | W | M | Q | Y | L | L | D | H | A | S | V | P | C | T | L | L | T | A | C | F | Y | V | A | M | F | A | S | L | C | F | I | T | E | I | A | L | D | R | Y | Y | A | I | V | Y | M | R | Y | R | P | V | K | Q | A | C | L | F | S | I | F | W | W | I | F | A | V | I | I | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | H | F | M | V | V | T | K | K | D | N | Q | C | M | T | D | Y | D | Y | L | E | V | S | Y | P | I | I | L | N | V | E | L | M | L | G | A | F | V | I | P | L | S | V | I | S | Y | C | Y | Y | R | I | S | R | I | V | A | V | S | Q | S | R | H | K | G | R | I | V | R | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | A | V | V | L | V | F | I | I | F | W | L | P | Y | H | L | T | L | F | V | D | T | L | K | L | L | K | W | I | S | S | S | C | E | F | E | R | S | L | K | R | A | L | I | L | T | E | S | L | A | F | C | H | C | C | L | N | P | L | L | Y | V | F | V | G | T | K | F | R | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | L | H | C | L | L | A | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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