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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4xijA_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: shikimate 5-dehydrogenase; | PDBTitle: crystal structure of a shikimate 5-dehydrogenase from mycobacterium2 fortuitum determined by iodide sad phasing |
Added to library: Sat Feb 14 08:22:14 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | M | V | P | D | S | R | K | A | A | V | L | G | S | P | I | T | H | S | R | S | P | Q | L | H | L | A | A | Y | R | A | L | G | L | P | S | W | T | Y | E | R | I | E | C | T | A | E | Q | L | P | G | L | V | S | A | L | G | P | E | W | V | G | L | S | V | T | M | P | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | A | A | L | E | F | A | D | Q | R | T | D | R | A | Q | L | V | G | S | A | N | T | L | V | R | M | P | T | G | G | W | R | A | D | N | T | D | V | D | G | V | T | G | A | L | G | T | A | G | D | S | A | L | V | I | G | S | G | G | T | A | P | A | A | V | V | A | L | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | T | T | S | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | G | V | Q | R | I | T | I | V | A | R | D | E | G | K | A | S | R | L | V | D | L | A | R | R | C | G | A | Q | G | G | W | C | D | I | G | G | A | A | L | A | D | A | V | A | S | A | D | A | A | V | S | T | I | P | A | D | A | A | A | V | Y | A | D | A | L | A | R | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | R | V | L | D | A | I | Y | D | P | W | P | T | P | L | A | Q | A | V | E | A | A | G | G | E | A | I | N | G | L | Q | M | L | L | N | Q | A | F | A | Q | V | E | Q | F | T | G | M | P | A | P | K | E | A | M | R | A | A | L | G | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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