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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4xh9D_ | PDB header: signaling protein | Chain: D: PDB Molecule: neuroepithelial cell-transforming gene 1 protein; | PDBTitle: crystal structure of human rhoa in complex with dh/ph fragment of the2 guanine nucleotide exchange factor net1 |
Added to library: Sat Jan 17 08:42:20 2015 | |
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Sequence | S | E | M | L | D | I | T | M | K | E | S | L | T | T | R | E | I | R | R | Q | E | A | I | Y | E | M | S | R | G | E | Q | D | L | I | E | D | L | K | L | A | R | K | A | Y | H | D | P | M | L | K | L | S | I | M | S | E | E | E | L | T | H | I | F | G | D | L | D | S | Y | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | L | H | E | D | L | L | T | R | I | G | E | A | T | K | P | D | G | T | V | E | Q | I | G | H | I | L | V | S | W | L | P | R | L | N | A | Y | R | G | Y | C | S | N | Q | L | A | A | K | A | L | L | D | Q | K | K | Q | D | P | R | V | Q | D | F | L | Q | R | C | L | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | T | T | S | B | S | G | G | G | G | G | G | G | T | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | F | S | R | K | L | D | L | W | S | F | L | D | I | P | R | S | R | L | V | K | Y | P | L | L | L | K | E | I | L | K | H | T | P | K | E | H | P | D | V | Q | L | L | E | D | A | I | L | I | I | Q | G | V | L | S | D | I | N | L | K | K | G | E | S | E | C | Q | Y | Y | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | K | L | E | Y | L | D | E | K | Q | R | D | P | R | I | E | A | S | K | V | L | L | C | H | G | E | L | R | S | K | S | G | H | K | L | Y | I | F | L | F | Q | D | I | L | V | L | T | R | P | V | T | R | N | E | R | H | S | Y | Q | V | Y | R | Q | P | I | P | V | Q | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | T | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | V | L | E | D | L | Q | D | G | D | V | R | M | A | K | N | I | F | R | I | R | F | H | D | P | S | P | A | Q | S | H | T | L | Q | A | N | D | V | F | H | K | Q | Q | W | F | N | C | I | R | A | A | I | A | H | H | H | H | H | H | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | S |
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