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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4x2zA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: nonstructural protein 3; | PDBTitle: structural view and substrate specificity of papain-like protease from2 avian infectious bronchitis virus |
Added to library: Sat Jan 31 08:19:39 2015 | |
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Sequence | Q | K | T | I | Y | L | T | E | D | G | V | K | Y | R | S | I | V | L | K | P | G | D | S | L | G | Q | F | G | Q | V | Y | A | K | N | K | I | V | F | T | A | D | D | V | E | D | K | E | I | L | Y | V | P | T | T | D | K | S | I | L | E | Y | Y | G | L | D | A | Q | K | Y | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | G | S | S | B | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | Y | L | Q | T | L | A | Q | K | W | N | V | Q | Y | R | D | N | F | L | I | L | E | W | R | D | G | N | C | W | I | S | S | A | I | V | L | L | Q | A | A | K | I | R | F | K | G | F | L | T | E | A | W | A | K | L | L | G | G | D | P | T | D | F | V | A | W | C | Y | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | C | T | A | K | V | G | D | F | S | D | A | N | W | L | L | A | N | L | A | E | H | F | D | A | D | Y | T | N | A | F | L | K | K | R | V | S | C | N | C | G | I | K | S | Y | E | L | R | G | L | E | A | C | I | Q | P | V | R | A | T | N | L | L | H | F | K | T | Q | Y | S | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | B | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | C | P | T | C | G | A | N | N | T | D | E | V | I | E | A | S | L | P | Y | L | L | L | F | A | T | D | G | P | A | T | V | D | C | D | E | D | A | V | G | T | V | V | F | V | G | S | T | N | S | G | H | C | Y | T | Q | A | A | G | Q | A | F | D | N | L | A | K | D | R | K | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | K | K | S | P | Y | I | T | A | X | Y | T | R | F | A | F | K | N | E | T | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
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