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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4wzgA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: autophagy-related protein 101; | PDBTitle: structure of human atg101 |
Added to library: Sat Jun 20 08:29:53 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | N | C | R | S | E | V | L | E | V | S | V | E | G | R | Q | V | E | E | A | M | L | A | V | L | H | T | V | L | L | H | R | S | T | G | K | F | H | Y | K | K | E | G | T | Y | S | I | G | T | V | G | T | Q | D | V | D | C | D | F | I | D | F | T | Y | V | R | V | S | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | L | D | R | A | L | R | K | V | V | G | E | F | K | D | A | L | R | N | S | G | G | D | G | L | G | Q | M | S | L | E | F | Y | Q | K | K | K | S | R | W | P | F | S | D | E | C | I | P | W | E | V | W | T | V | K | V | H | V | V | A | L | A | T | E | Q | E | R | Q | I | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | E | K | V | G | E | K | L | C | E | K | I | I | N | I | V | E | V | M | N | R | H | E | Y | L | P | K | M | P | T | Q | S | E | V | D | N | V | F | D | T | G | L | R | D | V | Q | P | Y | L | Y | K | I | S | F | Q | I | T | D | A | L | G | T | S | V | T | T | T | M | R | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | T | B | T | T | S | S | B | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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