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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4wwuE_ | PDB header: transport protein | Chain: E: PDB Molecule: mrna export factor mex67; | PDBTitle: structure of mex67:mtr2 |
Added to library: Sat Feb 7 08:51:05 2015 | |
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Sequence | T | S | D | T | I | S | F | L | R | G | V | L | L | K | R | Y | D | P | Q | T | K | L | L | N | L | G | A | L | H | S | D | P | E | L | I | Q | K | G | V | F | S | K | M | F | P | A | M | M | K | L | A | S | T | E | K | S | L | I | V | E | S | V | N | L | A | D | N | Q | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | I | S | A | I | S | T | L | A | Q | T | F | P | N | L | K | N | L | C | L | A | N | N | Q | I | F | R | F | R | S | L | E | V | W | K | N | K | F | K | D | L | R | E | L | L | M | T | N | N | P | I | T | T | D | K | L | Y | R | T | E | M | L | R | L | F | P | K | L | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | G | T | T | T | T | S | S | T | G | G | G | G | G | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | G | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | D | N | V | I | V | R | D | E | Q | K | L | Q | T | V | Y | S | L | P | M | K | I | Q | Q | F | F | F | E | N | D | A | L | G | Q | S | S | T | D | F | A | T | N | F | L | N | L | W | D | N | N | R | E | Q | L | L | N | L | Y | S | P | Q | S | Q | F | S | V | S | V | D | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | I | P | P | S | T | V | T | D | S | D | Q | T | P | A | F | G | Y | Y | M | S | S | S | R | N | I | S | K | V | S | S | E | K | S | I | Q | Q | R | L | S | I | G | Q | E | S | I | N | S | I | F | K | T | L | P | K | T | K | H | H | L | Q | E | Q | P | N | E | Y | S | M | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | B | S | S | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | T | I | S | Y | P | Q | I | N | G | F | V | I | T | L | H | G | F | F | E | E | T | G | K | P | E | L | E | S | N | N | K | L | S | K | K | S | F | D | R | T | W | V | I | V | P | M | N | N | S | V | I | I | A | S | D | L | L | T | V | R | A | Y | S | T | G | A | W | K | T | |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | T | T |
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