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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4wpcB_ | PDB header: lipid binding protein | Chain: B: PDB Molecule: rho gtpase-activating protein rgd1; | PDBTitle: crystal structure of rgd1p f-bar domain in complex with inositol2 phosphate |
Added to library: Sat Dec 27 08:22:47 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | L | A | H | L | F | S | T | P | E | I | K | K | V | L | N | S | D | V | A | I | A | L | L | S | R | L | K | Q | S | L | L | T | C | E | E | F | M | K | F | I | R | K | K | Y | A | F | E | E | E | H | V | Q | E | L | S | K | Q | Y | K | H | F | F | N | I | N | S | S | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | M | I | H | E | V | L | G | F | D | G | K | M | A | Q | V | K | Q | S | Y | I | T | A | L | Q | K | M | Y | S | E | I | S | S | L | L | L | T | M | T | K | L | R | K | S | V | K | E | N | S | K | R | L | E | K | D | V | S | D | A | I | H | S | A | E | K | A | Q | S | R | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | S | L | C | Q | D | W | D | K | L | R | M | T | D | T | K | L | T | L | R | G | S | K | T | T | K | E | Q | E | E | E | L | L | R | K | I | D | N | A | D | L | E | Y | K | Q | K | V | D | H | S | N | S | L | R | N | T | F | I | T | K | E | R | P | R | I | V | Q | E | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | L | I | L | E | I | D | T | A | M | T | I | Q | L | Q | K | Y | T | I | W | T | E | N | L | V | L | N | T | G | V | T | I | S | P | L | S | T | K | S | M | K | S | F | A | G | S | V | S | N | E | R | D | L | Y | S | F | L | N | K | Y | N | S | L | L | I | N | K | N | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | P | V | S | Y | K | K | H | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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