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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4wmyB_ | PDB header: sugar binding protein | Chain: B: PDB Molecule: intelectin-1; | PDBTitle: structure of human intelectin-1 in complex with allyl-beta-2 galactofuranose |
Added to library: Sat Jul 4 08:18:09 2015 | |
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Sequence | W | T | C | S | L | P | R | S | C | K | E | I | K | D | E | C | P | S | A | F | D | G | L | Y | F | L | R | T | E | N | G | V | I | Y | Q | T | F | C | D | M | T | S | G | G | G | G | W | T | L | V | A | S | V | H | E | N | D | M | R | G | K | C | T | V | G | D | R | W | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | Q | G | S | K | A | V | Y | P | E | G | D | G | N | W | A | N | Y | N | T | F | G | S | A | E | A | A | T | S | D | D | Y | K | N | P | G | Y | Y | D | I | Q | A | K | D | L | G | I | W | H | V | P | N | K | S | P | M | Q | H | W | R | N | S | S | L | L | R | Y | R | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | B | S | S | T | T | T | T | T | S | T | S | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | G | F | L | Q | T | L | G | H | N | L | F | G | I | Y | Q | K | Y | P | V | K | Y | G | E | G | K | C | W | T | D | N | G | P | V | I | P | V | V | Y | D | F | G | D | A | Q | K | T | A | S | Y | Y | S | P | Y | G | Q | R | E | F | T | A | G | F | V | Q | F | R | V | F | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | N | E | R | A | A | N | A | L | C | A | G | M | R | V | T | G | C | N | T | E | H | H | C | I | G | G | G | G | Y | F | P | E | A | S | P | Q | Q | C | G | D | F | S | G | F | D | W | S | G | Y | G | T | H | V | G | Y | S | S | S | R | E | I | T | E | A | A | V | L | L | F | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | G | G | G | T | B | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | B | T | T | S | T | T | B | S | T | T | B | B | T |   | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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