|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4wm8B_ | PDB header: virus | Chain: B: PDB Molecule: vp2; | PDBTitle: crystal structure of human enterovirus d68 |
Added to library: Sat Jan 17 09:11:26 2015 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | S | D | R | V | L | Q | L | K | L | G | N | S | A | I | V | T | Q | E | A | A | N | Y | C | C | A | Y | G | E | W | P | N | Y | L | P | D | H | E | A | V | A | I | D | K | P | T | Q | P | E | T | S | T | D | R | F | Y | T | L | R | S | V | K | W | E | S | N | S | T | G | W | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | S | B | G | G | G | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | W | K | L | P | D | A | L | N | N | I | G | M | F | G | Q | N | V | Q | Y | H | Y | L | Y | R | S | G | F | L | I | H | V | Q | C | N | A | T | K | F | H | Q | G | A | L | L | V | V | A | I | P | E | H | Q | R | G | A | H | D | T | T | T | S | P | G | F | N | D | I | M | K | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | R | G | G | T | F | N | H | P | Y | V | L | D | D | G | T | S | I | A | C | A | T | I | F | P | H | Q | W | I | N | L | R | T | N | N | S | A | T | I | V | L | P | W | M | N | V | A | P | M | D | F | P | L | R | H | N | Q | W | T | L | A | V | I | P | V | V | P | L | G | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | T | T | G | G | G | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||
Sequence | R | T | M | S | S | V | V | P | I | T | V | S | I | A | P | M | C | C | E | F | N | G | L | R | H | A | I | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|