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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4wkrB_ | PDB header: rna-binding protein | Chain: B: PDB Molecule: la-related protein 7; | PDBTitle: larp7 wrapping up the 3' hairpin of 7sk non-coding rna (302-332) |
Added to library: Sat Mar 21 09:10:07 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | R | V | K | Q | V | L | A | D | I | A | K | Q | V | D | F | W | F | G | D | A | N | L | H | K | D | R | F | L | R | E | Q | I | E | K | S | R | D | G | Y | V | D | I | S | L | L | V | S | F | N | K | M | K | K | L | T | T | D | G | K | L | I | A | R | A | L | R | S | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | S | T | T | S | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | V | E | L | D | L | E | G | T | R | I | R | R | K | K | P | L | G | E | R | P | K | D | E | D | E | R | T | V | Y | V | E | L | L | P | K | N | V | N | H | S | W | I | E | R | V | F | G | K | C | G | N | V | V | Y | I | S | I | P | H | Y | K | S | T | G | D | P | K | G | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | B | S | S | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | F | V | E | F | E | T | K | E | Q | A | A | K | A | I | E | F | L | N | N | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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