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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4wiwB_ | PDB header: hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: glycoside hydrolase family 18; | PDBTitle: crystal structure of c-terminal domain of putative chitinase from2 desulfitobacterium hafniense dcb-2 |
Added to library: Sat Oct 11 08:31:52 2014 | |
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Sequence | N | A | K | I | S | L | Q | Y | W | D | G | Y | A | S | Y | E | T | Y | L | R | Q | L | S | L | I | P | G | K | A | T | D | Y | V | D | Y | V | S | P | N | W | R | G | S | I | G | T | D | G | S | L | K | L | V | W | D | E | G | S | S | N | Y | K | Q | L | T | N | X | A | H | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | G | G | G | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | G | X | K | V | L | P | L | I | N | G | S | G | A | T | L | N | T | L | L | K | S | P | A | A | R | E | K | L | I | G | E | I | V | V | L | L | K | N | T | N | A | D | G | V | V | I | D | F | E | T | P | L | D | Y | G | D | V | K | D | P | Y | D | G | V | R | N | D | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | F | X | E | S | L | H | S | E | L | Q | S | X | N | K | L | V | V | X | A | V | X | P | R | X | S | S | S | Q | Y | W | L | D | A | Y | D | Y | E | A | L | S | H | A | V | D | Y | L | H | V | X | T | Y | D | H | H | Y | R | T | S | A | P | G | P | I | A | P | Y | P | W | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | Q | V | L | T | Y | I | Q | G | Q | G | V | D | X | S | K | V | L | X | G | I | P | Y | Y | G | R | D | W | V | V | D | G | K | D | A | N | G | N | P | T | Y | N | S | T | A | F | G | Y | S | K | A | L | E | L | A | D | S | Y | G | A | T | I | T | Y | S | K | Y | N | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | B | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | D | P | V | G | T | P | T | F | K | Y | T | D | E | K | G | V | E | H | T | V | F | F | D | D | Y | T | S | W | N | A | K | L | S | I | I | N | E | F | G | L | A | G | V | G | P | W | A | X | G | W | V | D | E | N | T | A | E | G | L | F | P | L | L | N | Q | H | L | R | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | B | G | G | G |
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