|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4w8xA_ | PDB header: rna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: crispr system cmr subunit cmr1-1; | PDBTitle: crystal structure of cmr1 from pyrococcus furiosus bound to a2 nucleotide |
Added to library: Sat Oct 18 08:25:19 2014 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | M | F | I | E | E | F | E | I | E | S | I | T | S | T | H | L | L | E | V | L | T | R | E | Y | P | E | V | R | S | P | S | I | K | G | A | M | R | W | W | F | R | A | L | A | G | S | Y | F | G | D | D | A | Q | K | L | K | E | I | E | N | Q | V | F | G | S | T | K | E | R | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | G | G | G | G | T | T | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | V | K | I | S | V | T | P | L | S | S | P | K | R | L | N | L | K | E | F | K | D | K | N | V | G | Y | I | W | F | S | I | N | L | L | G | K | R | G | T | I | T | H | Y | Y | P | P | G | S | R | F | R | V | V | L | E | S | P | S | E | R | V | I | K | L | A | T | L | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | W | A | L | V | S | L | G | S | V | G | F | R | S | R | R | G | T | G | S | M | K | I | V | R | A | S | S | E | V | L | E | D | L | G | L | T | T | E | F | N | S | I | D | E | F | K | D | S | L | K | R | V | L | D | V | T | G | E | I | L | G | V | S | L | P | S | Y | A | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | B | T | T | T | T | S | S | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | F | S | D | V | E | V | F | G | P | G | K | N | T | W | E | V | L | A | Q | F | N | N | S | Y | K | E | Y | L | R | R | R | I | K | K | Y | Q | R | I | I | F | G | L | P | R | F | K | L | R | G | V | R | K | D | L | R | R | A | S | P | L | W | F | G | V | V | E | I | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||
Sequence | K | P | Y | G | R | I | I | K | F | F | Q | S | T | F | H | P | E | V | R | S | K | H | I | V | D | W | N | V | L | S | N | F | D | W | F | I | S | S | R | L | P | V | T | K | V | W | G | G | W | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | B | G | G | G | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|