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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4v2aA_ | PDB header: apoptosis | Chain: A: PDB Molecule: netrin receptor unc5a; | PDBTitle: human unc5a ectodomain |
Added to library: Sat Nov 8 08:59:39 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | P | H | F | L | V | E | P | E | D | V | Y | I | V | K | N | K | P | V | L | L | V | C | K | A | V | P | A | T | Q | I | F | F | K | C | N | G | E | W | V | R | Q | V | D | H | V | I | E | R | S | T | D | G | S | N | G | L | P | T | M | E | V | R | I | N | V | S | R | Q | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | E | K | V | F | G | L | E | E | Y | W | C | Q | C | V | A | W | S | S | S | G | T | T | K | S | Q | K | A | Y | I | R | I | A | Y | L | R | K | N | F | E | Q | E | P | L | A | K | E | V | S | L | E | Q | G | I | V | L | P | C | R | P | P | E | G | I | P | P | A | E | V | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | B | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | W | L | R | N | E | D | L | V | D | P | S | L | D | P | N | V | Y | I | T | R | E | H | S | L | V | V | R | Q | A | R | L | A | D | T | A | N | Y | T | C | V | A | K | N | I | V | A | R | R | R | S | A | S | A | A | V | I | V | Y | V | D | G | S | W | S | P | W | S | K | W | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||
Sequence | A | C | G | L | D | C | T | H | W | R | S | R | E | C | S | D | P | A | P | R | N | G | G | E | E | C | Q | G | T | D | L | D | T | R | N | C | C | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | B | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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