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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4v1nR_ | PDB header: transcription | Chain: R: PDB Molecule: transcription initiation factor iif subunit beta; | PDBTitle: architecture of the rna polymerase ii-mediator core2 transcription initiation complex |
Added to library: Sat Feb 7 08:38:45 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | E | S | L | D | L | D | L | E | R | S | N | R | Q | V | W | L | V | R | L | P | M | F | L | A | E | K | W | R | D | R | N | N | L | H | G | Q | E | L | G | K | I | R | I | N | K | D | G | S | K | I | T | L | L | L | N | E | N | D | N | D | S | I | P | H | E | Y | D | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||
Sequence | L | T | K | K | V | V | E | N | E | Y | V | F | T | E | Q | N | L | K | K | T | A | I | V | G | T | V | C | H | E | C | Q | V | M | P | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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