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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4uxeB_ | PDB header: viral protein | Chain: B: PDB Molecule: large tail fiber protein p34; | PDBTitle: crystal structure of the carboxy-terminal region of the2 bacteriophage t4 proximal long tail fibre protein gp34,3 p21 selenomethionine crystal |
Added to library: Sat Aug 22 08:17:09 2015 | |
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Sequence | P | S | Q | F | I | R | R | D | I | A | Q | T | V | N | G | S | L | T | L | T | Q | Q | T | N | L | S | A | P | L | V | S | S | S | T | G | E | F | G | G | S | L | A | A | N | R | T | F | T | I | R | N | T | G | A | P | T | S | I | V | F | E | K | G | P | A | S | G | A | N | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | Q | S | X | S | I | R | V | W | G | N | Q | F | G | G | G | S | D | T | T | R | S | T | V | F | E | V | G | D | D | T | S | H | H | F | Y | S | Q | R | N | K | D | G | N | I | A | F | N | I | N | G | T | V | X | P | I | N | I | N | A | S | G | L | X | N | V | N | G | T | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | F | G | R | S | V | T | A | N | G | E | F | I | S | K | S | A | N | A | F | R | A | I | N | G | D | Y | G | F | F | I | R | N | D | A | S | N | T | Y | F | L | L | T | A | A | G | D | Q | T | G | G | F | N | G | L | R | P | L | L | I | N | N | Q | S | G | Q | I | T | I | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | G | L | I | I | A | K | G | V | T | I | N | S | G | G | L | T | V | N | S | R | I | R | S | Q | G | T | K | T | S | D | L | Y | T | R | A | P | T | S | D | T | V | G | F | W | S | I | D | I | N | D | S | A | T | Y | N | Q | F | P | G | Y | F | K | X | V | E | K | T | N | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | B | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | V | T | G | L | P | Y | L | E | R | G | E | E | V | K | S | P | G | T | L | T | Q | F | G | N | T | L | D | S | L | Y | Q | D | W | I | T | Y | P | T | T | P | E | A | R | T | T | R | W | T | R | T | W | Q | K | T | K | N | S | W | S | S | F | V | Q | V | F | D | G | G | N | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | T | B | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | ||||
Sequence | P | Q | P | S | D | I | G | A | L | P | S | D | N | A | T | X | G | N | L | T | I | R | D | F | L | R | I | G | N | V | R | I | V | P | D | P | V | N | K | T | V | K | F | E | W | V | E | |||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | T |
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