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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ux8E_ | PDB header: signaling protein | Chain: E: PDB Molecule: gdnf family receptor alpha-1; | PDBTitle: ret recognition of gdnf-gfralpha1 ligand by a composite binding site2 promotes membrane-proximal self-association |
Added to library: Sat Oct 4 09:57:35 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | R | L | D | C | V | K | A | S | D | Q | C | L | K | E | Q | S | C | S | T | K | Y | R | T | L | R | Q | C | V | A | G | K | E | T | N | F | S | L | T | S | G | L | E | A | K | D | E | C | R | S | A | M | E | A | L | K | Q | K | S | L | Y | N | C | R | C | K | R | G | M | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | E | K | N | C | L | R | I | Y | W | S | M | Y | Q | S | K | G | N | N | C | L | D | A | A | K | A | C | N | L | D | D | T | C | K | K | Y | R | S | A | Y | I | T | P | C | T | T | S | M | S | N | E | V | C | N | R | R | K | C | H | K | A | L | R | Q | F | F | D | K | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | K | H | S | Y | G | M | L | F | C | S | C | R | D | I | A | C | T | E | R | R | R | Q | T | I | V | P | V | C | S | Y | E | E | R | E | R | P | N | C | L | S | L | Q | D | S | C | K | T | N | Y | I | C | R | S | R | L | A | D | F | F | T | N | C | Q | P | E | S | R | S | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | S | S | B | S | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | N | C | L | K | E | N | Y | A | D | C | L | L | A | Y | S | G | L | I | G | T | V | M | T | P | N | Y | V | D | S | S | S | L | S | V | A | P | W | C | D | C | S | N | S | G | N | D | L | E | D | C | L | K | F | L | N | F | F | K | D | N | T | C | L | K | N | A | I | Q | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B | T | T | G | G | G | T |   | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | G | N | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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