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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ux7A_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: putative peptidase c60b, sortase b; | PDBTitle: structure of a clostridium difficile sortase |
Added to library: Sat Apr 4 08:54:08 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | K | A | G | S | A | A | A | P | F | T | H | D | T | K | I | S | S | E | L | Q | K | K | E | Y | K | K | E | D | L | S | K | I | N | S | D | F | K | F | W | L | S | V | E | N | T | N | I | N | Y | P | V | V | Q | S | K | D | N | S | Y | Y | L | D | K | D | F | Y | K | K | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | G | G | G | G | B | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | I | S | G | T | L | F | M | D | Y | R | N | K | S | I | D | D | K | N | I | I | I | Y | G | H | N | M | K | N | K | T | M | F | N | N | L | N | K | F | K | D | A | D | F | F | K | K | N | N | K | I | K | I | T | L | N | G | K | E | F | L | Y | D | V | F | S | A | Y | I | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | B | T | T | S | B | T | G | G | G | G | G | G | G | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . |
Sequence | E | S | D | Y | D | Y | L | K | T | N | F | N | N | E | S | D | Y | Q | N | Y | I | N | D | I | T | S | K | S | L | Y | K | S | P | I | K | V | N | S | N | D | K | I | V | T | L | S | T | A | T | Y | E | F | D | D | A | R | M | V | I | H | G | R | L | I | ||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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