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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4uv3I_ | PDB header: transport protein | Chain: I: PDB Molecule: curli production assembly/transport component csgg; | PDBTitle: structure of the curli transport lipoprotein csgg in its2 membrane-bound conformation |
Added to library: Sat Sep 27 08:14:14 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | T | A | P | P | K | E | A | A | R | P | T | L | M | P | R | A | Q | S | Y | K | D | L | T | H | L | P | A | P | T | G | K | I | F | V | S | V | Y | N | I | Q | D | E | T | G | Q | F | K | P | Y | P | A | S | N | F | S | T | A | V | P | Q | S | A | T | A | M | L | V | T | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | B | S | S | T | T | B | T | T | S | T | T | B | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | K | D | S | R | W | F | I | P | L | E | R | Q | G | L | Q | N | L | L | N | E | R | K | I | I | R | A | A | Q | E | N | G | T | V | A | I | N | N | R | I | P | L | Q | S | L | T | A | A | N | I | M | V | E | G | S | I | I | G | Y | E | S | N | V | K | S | G | G | V | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | Y | G | I | G | A | D | T | Q | Y | Q | L | D | Q | I | A | V | N | L | R | V | V | N | V | S | T | G | E | I | L | S | S | V | N | T | S | K | T | I | L | S | Y | E | V | Q | A | G | V | F | L | E | G | E | V | G | Y | T | S | N | E | P | V | M | L | C | L | M | S | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | T | G | V | I | F | L | I | N | D | G | I | D | R | G | L | W | D | L | Q | N | K | A | E | R | Q | N | D | I | L | V | K | Y | R | H | M | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | B | S | G | G | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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