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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ukpi_ | PDB header: ribosome | Chain: I: PDB Molecule: 40s ribosomal protein s7-a; | PDBTitle: crystal structure of deoxynivalenol bound to the yeast 80s ribosome |
Added to library: Sat Oct 25 09:03:53 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | N | D | V | E | D | A | D | V | V | V | L | P | P | K | E | I | V | K | S | N | T | S | S | K | K | A | D | V | P | P | P | S | A | D | P | S | K | A | R | K | N | R | P | R | P | S | G | N | E | G | A | I | R | D | K | T | A | G | R | R | N | N | R | S | K | D | V | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | A | T | T | K | K | S | N | T | R | R | A | T | D | R | H | S | R | T | G | K | T | D | T | K | K | K | V | N | Q | G | W | G | D | D | K | K | E | L | S | A | E | K | E | A | Q | A | D | A | A | A | E | I | A | E | D | A | A | E | A | E | D | A | L | Q | D | Y | L | N | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | A | N | N | Q | F | N | K | V | P | E | A | K | K | V | E | L | D | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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