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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4uj8D_ | 1.70 | PDB header: membrane protein | Chain: D: PDB Molecule: surface layer protein; |
Added to library: Sat Apr 30 08:57:47 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | N | V | V | A | G | G | P | V | A | N | Y | Q | I | K | V | L | D | D | G | K | I | D | K | S | A | T | E | S | P | A | N | N | D | V | Q | L | K | V | Y | A | V | D | A | N | G | N | I | V | G | D | I | T | N | D | V | T | I | T | S | E | A | T | D | T | N | G | V | I | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | A | S | K | S | T | A | N | G | D | T | V | Y | V | I | T | D | N | G | S | K | K | V | G | K | E | T | L | T | V | K | L | G | T | V | T | L | G | T | V | D | V | E | V | I | D | T | T | L | K | A | T | V | V | T | K | K | A | D | L | I | E | L | D | A | A | D | N | G | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | L | A | K | L | L | A | N | L | D | I | K | D | Q | N | G | N | P | M | V | D | S | A | A | T | P | N | T | N | E | K | L | Q | A | L | K | S | V | L | S | G | I | V | S | S | D | T | S | V | I | G | S | V | S | N | V | D | N | L | K | D | D | A | S | I | S | G | L | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | B | T | T | T | T | S | T | T | T | B | B | S | S | G | G | G | S | B | S | S | S | B | B | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | |||||||||||
Sequence | K | K | A | G | T | V | T | L | T | L | V | F | N | E | D | S | K | I | A | P | I | A | I | T | V | K | A | P | A | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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