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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4u8tD_ | PDB header: rna binding protein/rna | Chain: D: PDB Molecule: zyro0g01672p; | PDBTitle: crystal structure of yth domain of zygosaccharomyces rouxii mrb12 protein in complex with n6-methyladenosine rna |
Added to library: Sat Sep 13 08:15:18 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | A | I | I | P | P | W | I | H | V | P | D | H | S | R | F | F | V | I | K | S | S | S | L | E | H | V | K | K | S | F | Y | N | G | I | W | S | S | T | F | Y | G | N | K | R | L | S | E | A | Y | E | S | L | P | Q | G | A | K | I | Y | L | L | F | S | V | N | A | S | G | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | C | G | V | A | E | X | S | S | N | L | R | E | D | L | D | T | S | I | W | G | Y | R | H | A | F | K | V | R | W | I | V | V | R | D | V | H | N | R | S | L | K | Q | F | L | I | P | A | N | D | X | K | P | V | T | N | S | R | D | T | Q | E | I | P | A | T | I | S | K | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | S | G | G | G | G | B | G | G | G | T | T | T | G | G | G | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | L | K | L | F | K | Y | E | Q | S | E | V | Q | S | F | L | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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