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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4u7mA_ | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains | PDBTitle: lrig1 extracellular domain: structure and function analysis |
Added to library: Sat Apr 11 09:53:29 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | P | Q | I | I | T | Q | P | E | T | T | M | A | M | V | G | K | D | I | R | F | T | C | S | A | A | S | S | S | S | S | P | M | T | F | A | W | K | K | D | N | E | V | L | T | N | A | D | M | E | N | F | V | H | V | H | A | V | M | E | Y | T | T | I | L | H | L | R | Q | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | F | G | H | E | G | R | Y | Q | C | V | I | T | N | H | F | G | S | T | Y | S | H | K | A | R | L | T | V | N | V | L | P | S | F | T | K | T | P | H | D | I | T | I | R | T | T | T | M | A | R | L | E | C | A | A | T | G | H | P | N | P | Q | I | A | W | Q | K | D | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | T | T | S | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | D | F | P | A | A | R | E | R | R | M | H | V | M | P | D | D | D | V | F | F | I | T | D | V | K | I | D | D | A | G | V | Y | S | C | T | A | Q | N | S | A | G | S | I | S | A | N | A | T | L | T | V | L | E | T | P | S | L | V | V | P | L | E | D | R | V | V | S | V | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | T | V | A | L | Q | C | K | A | T | G | N | P | P | P | R | I | T | W | F | K | G | D | R | P | L | S | L | T | E | R | H | H | L | T | P | D | N | Q | L | L | V | V | Q | N | V | V | A | E | D | A | G | R | Y | T | C | E | M | S | N | T | L | G | T | E | R | A | H | S | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | S | V | L | L | E | N | L | Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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