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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4u5aD_ | PDB header: transport protein | Chain: D: PDB Molecule: sporozoite microneme protein essential for cell traversal; | PDBTitle: sporozoite protein for cell traversal |
Added to library: Sat Dec 27 08:33:26 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | N | N | I | I | E | E | F | D | K | L | S | D | D | F | S | N | D | I | N | A | T | K | Q | T | I | K | D | L | F | L | D | I | E | A | S | V | K | L | L | S | K | Y | S | F | V | P | E | E | K | L | N | I | I | D | G | I | L | R | S | F | I | E | N | N | K | T | H | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | S | S | N | A | Y | I | Y | I | Q | K | E | K | I | K | N | V | C | N | F | I | L | K | K | L | N | S | L | I | Q | I | N | E | L | N | K | S | H | I | I | L | K | Y | G | K | G | E | A | K | K | G | V | L | E | S | I | K | N | N | D | D | I | S | K | N | L | K | S | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | L | K | Y | V | S | E | L | I | N | F | I | T | P | I | Y | D | D | F | I | K | N | L | T | D | L | I | N | D | L | Q | I | K | L | K | N | I | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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