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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4u36A_ | PDB header: sugar binding protein | Chain: A: PDB Molecule: seed lectin; | PDBTitle: crystal structure of a seed lectin from vatairea macrocarpa complexed2 with tn-antigen |
Added to library: Sat Jan 3 08:14:38 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | E | V | V | S | F | S | F | T | K | F | N | P | N | P | K | D | I | I | L | Q | G | D | A | L | V | T | S | K | G | K | L | Q | L | T | K | V | K | D | G | K | P | V | D | H | S | L | G | R | A | L | Y | A | A | P | I | H | I | W | D | D | S | T | D | R | V | A | S | F | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | S | F | S | F | V | V | E | A | P | D | E | S | K | T | A | D | G | I | A | F | F | L | A | P | P | D | T | Q | P | Q | K | D | G | G | F | L | G | L | F | N | D | I | Q | T | V | A | V | E | F | D | T | F | S | N | T | W | D | P | S | A | R | H | I | G | I | N | V | N | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | G | G | G | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | E | S | M | K | Y | V | K | W | G | W | E | N | G | K | V | A | N | V | Y | I | S | Y | E | A | S | T | K | T | L | T | A | S | L | T | Y | P | S | N | A | T | S | Y | I | V | S | A | N | V | D | L | K | S | A | L | P | E | W | V | R | V | G | F | S | A | T | S | G | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | D | H | V | E | T | H | D | V | L | D | W | S | F | T | S | T | L | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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