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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4u2nA_ | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: zinc finger and btb domain-containing protein 17,nucleus | PDBTitle: crystal structure of a complex of the miz1- and nac1 poz domains. |
Added to library: Sat Dec 13 12:05:03 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | D | F | P | Q | H | S | Q | H | V | L | E | Q | L | N | Q | Q | R | Q | L | G | L | L | C | D | C | T | F | V | V | D | G | V | H | F | K | A | H | K | A | V | L | A | A | C | S | E | Y | F | K | M | L | F | V | D | K | D | V | V | H | L | D | I | S | N | A | A | G | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | V | L | E | F | M | Y | T | A | K | L | S | L | S | P | E | N | V | D | D | V | L | A | V | A | T | F | L | Q | M | Q | D | I | I | T | A | C | H | A | L | K | S | L | A | Q | T | L | Q | M | E | I | P | N | F | G | N | S | I | L | E | C | L | N | E | Q | R | L | Q | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | C | D | V | S | V | V | V | K | G | H | A | F | K | A | H | R | A | V | L | A | A | S | S | S | Y | F | R | D | L | F | N | N | S | R | S | A | V | V | E | L | P | A | A | V | Q | P | Q | S | F | Q | Q | I | L | S | F | C | Y | T | G | R | L | S | D | Q | D | L | L | M | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | A | G | F | L | Q | I | Q | E | I | M | E | K | G | T | E | F | F | L | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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