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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4u2mA_ | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: zinc finger and btb domain-containing protein 17,b-cell | PDBTitle: crystal structure of a complex of the miz1- and bcl6 poz domains. |
Added to library: Sat Dec 13 12:07:55 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | F | P | Q | H | S | Q | H | V | L | E | Q | L | N | Q | Q | R | Q | L | G | L | L | C | D | C | T | F | V | G | V | H | F | K | A | H | K | A | V | L | A | A | C | S | E | Y | F | K | M | L | F | V | D | Q | N | A | A | G | L | G | Q | V | L | E | F | M | Y | T | A | K | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | L | S | P | E | N | V | D | D | V | L | A | V | A | T | F | L | Q | M | Q | D | I | I | T | A | C | H | A | L | K | S | L | A | G | T | A | D | S | C | I | Q | F | T | R | H | A | S | D | V | L | L | N | L | N | R | L | R | S | R | D | I | L | T | D | V | V | I | V | V | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | E | Q | F | R | A | H | K | T | V | L | M | A | C | S | G | L | F | Y | S | I | F | T | D | Q | L | K | C | N | L | S | V | I | N | L | D | P | E | I | N | P | E | G | F | C | I | L | L | D | F | M | Y | T | S | R | L | N | L | R | E | G | N | I | M | A | V | M | A | T | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | M | Y | L | Q | M | E | H | V | V | D | T | C | R | K | F | I | K | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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