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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4tw1N_ | PDB header: toxin | Chain: N: PDB Molecule: possible leukocidin subunit; | PDBTitle: crystal structure of the octameric pore complex of the staphylococcus2 aureus bi-component toxin lukgh |
Added to library: Sat Nov 15 08:11:53 2014 | |
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Sequence | A | P | D | D | I | G | K | N | G | K | I | T | K | R | T | E | T | V | Y | D | E | K | T | N | I | L | Q | N | L | Q | F | D | F | I | D | D | P | T | Y | D | K | N | V | L | L | V | K | K | Q | G | S | I | H | S | N | L | K | F | E | S | H | K | E | E | K | N | S | N | W | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | Y | P | S | E | Y | H | V | D | F | Q | V | K | R | N | R | K | T | E | I | L | D | Q | L | P | K | N | K | I | S | T | A | K | V | D | S | T | F | S | Y | S | S | G | G | K | F | D | S | T | K | G | I | G | R | T | S | S | N | S | Y | S | K | T | I | S | Y | N | Q | Q | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | D | T | I | A | S | G | K | N | N | N | W | H | V | H | W | S | V | I | A | N | D | L | K | Y | G | G | E | V | K | N | R | N | D | E | L | L | F | Y | R | N | T | R | I | A | T | V | E | N | P | E | L | S | F | A | S | K | Y | R | Y | P | A | L | V | R | S | G | F | N | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | B | S | B | S | S | G | G | G | G | B | G | G | G | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | F | L | T | Y | L | S | N | E | K | S | N | E | K | T | Q | F | E | V | T | Y | T | R | N | Q | D | I | L | K | N | R | P | G | I | H | Y | A | P | P | I | L | E | K | N | K | D | G | Q | R | L | I | V | T | Y | E | V | D | W | K | N | K | T | V | K | V | V | D | K | Y | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | D | N | K | P | Y | K | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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