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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4tw1E_ | PDB header: toxin | Chain: E: PDB Molecule: possible leukocidin subunit; | PDBTitle: crystal structure of the octameric pore complex of the staphylococcus2 aureus bi-component toxin lukgh |
Added to library: Sat Nov 15 08:12:49 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | D | T | K | M | Y | T | R | T | A | T | T | S | D | S | Q | K | N | I | T | Q | S | L | Q | F | N | F | L | T | E | P | N | Y | D | K | E | T | V | F | I | K | A | K | G | T | I | G | S | G | L | R | I | L | D | P | N | G | Y | W | N | S | T | L | R | W | P | G | S | Y | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | S | I | Q | N | V | D | D | N | N | N | T | N | V | T | D | F | A | P | K | N | Q | D | E | S | R | E | V | K | Y | T | Y | G | Y | K | T | G | G | D | F | S | I | N | R | G | G | L | T | G | N | I | T | K | E | S | N | Y | S | E | T | I | S | Y | Q | Q | P | S | Y | R | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | L | D | Q | S | T | S | H | K | G | V | G | W | K | V | E | A | H | L | I | N | N | M | G | H | D | H | T | R | Q | L | T | N | D | S | D | N | R | T | K | S | E | I | F | S | L | T | R | N | G | N | L | W | A | K | D | N | F | T | P | K | D | K | M | P | V | T | V | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | B | T | T | B | S | S | S | S | S | S | T | T | B | G | G | G | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | F | N | P | E | F | L | A | V | M | S | H | D | K | K | D | K | G | K | S | Q | F | V | V | H | Y | K | R | S | M | D | E | F | K | I | D | W | N | R | H | G | F | W | G | Y | W | S | G | E | N | H | V | D | K | K | E | E | K | L | S | A | L | Y | E | V | D | W | K | T | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | V | K | F | V | K | V | L | N | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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