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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4tvsB_ | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: torsin-1a-interacting protein 1; | PDBTitle: lap1(aa356-583), h.sapiens, bound to vhh-bs1 |
Added to library: Sat Sep 6 08:15:02 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | T | A | V | Q | E | F | Q | N | Q | M | N | Q | L | K | N | K | Y | Q | G | Q | D | E | K | L | W | K | R | S | Q | T | F | L | E | K | H | L | N | S | S | H | P | R | S | Q | P | A | I | L | L | L | T | A | A | R | D | A | E | E | A | L | R | C | L | S | E | Q | I | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | Y | S | S | F | R | S | V | R | A | I | R | I | D | G | T | D | K | A | T | Q | D | S | D | T | V | K | L | E | V | D | Q | E | L | S | N | G | F | K | N | G | Q | N | A | A | V | V | H | R | F | E | S | F | P | A | G | S | T | L | I | F | Y | K | Y | C | D | H | E | N | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | G | G | G | T | T | T | S | T | T | T | G | G | G | S | G | G | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | F | K | D | V | A | L | V | L | T | V | L | L | E | E | E | T | L | G | T | S | L | G | L | K | E | V | E | E | K | V | R | D | F | L | K | V | K | F | T | N | S | N | T | P | N | S | Y | N | H | M | D | P | D | K | L | N | G | L | W | S | R | I | S | H | L | V | L | P | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | P | E | N | A | L | K | R | G | I | C | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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