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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4trkA_ | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: c. elegans him-3; | PDBTitle: structure of c. elegans him-3 |
Added to library: Sat Nov 22 08:14:21 2014 | |
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Sequence | S | Q | W | K | A | T | F | P | V | D | L | E | I | E | K | N | S | E | M | F | A | L | R | Y | I | K | C | A | S | A | F | I | L | D | R | R | G | I | L | D | E | K | C | F | K | T | R | T | I | D | K | L | L | V | T | A | F | Q | S | S | V | P | A | A | K | R | V | S | S | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | D | G | L | R | D | A | I | Q | Q | G | Y | L | R | E | F | A | I | V | F | Y | K | K | P | N | E | E | D | I | N | E | V | F | A | F | R | F | A | Y | G | D | E | G | E | I | F | V | S | L | N | N | G | I | D | T | N | E | S | S | Q | E | L | L | Q | A | K | F | V | D | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | T | T | B | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | N | T | K | Q | M | F | A | S | T | I | K | K | L | H | R | C | I | K | K | M | E | P | L | P | Q | G | S | D | A | S | F | R | V | S | Y | T | E | K | A | P | K | D | Y | T | P | E | G | Y | L | L | S | P | M | F | Y | T | L | N | Q | D | I | R | K | A | S | I | G | I | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | C | G | G | H | H | K | I | Q | M | L | A | A | S | Q | Y | L | K | Q | D | F | P | N | M | S | P | Y | G | L | S | Q | G | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | B | S | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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