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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4tn0C_ | PDB header: transferase | Chain: C: PDB Molecule: upf0141 protein yjdb; | PDBTitle: crystal structure of the c-terminal periplasmic domain of2 phosphoethanolamine transferase eptc from campylobacter jejuni |
Added to library: Sat Oct 11 08:53:08 2014 | |
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Sequence | M | F | K | T | I | A | N | D | A | Y | R | H | T | K | K | L | L | V | L | V | V | G | E | T | A | R | A | A | N | Y | S | L | G | G | Y | T | K | N | D | T | N | F | Y | T | K | K | D | N | V | V | F | F | D | N | F | S | S | C | G | T | A | A | V | S | L | P | C | M | F | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | S | S | G | G | G | G | G | G | T | S | S | T | T | T | T | G | G | G | G | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | S | K | R | E | N | Y | S | S | S | E | F | Q | E | N | A | M | D | V | L | Y | K | T | G | V | D | A | A | W | F | D | N | N | S | G | G | C | K | G | V | C | D | R | L | A | Y | K | Q | K | L | S | S | D | L | D | E | N | L | L | I | P | F | K | E | K | L | N | H | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | B | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | Q | N | I | I | V | L | H | L | Q | G | S | H | G | P | T | Y | Y | K | R | Y | P | S | E | F | K | K | F | T | P | T | C | D | T | N | E | L | S | K | C | D | S | E | A | L | I | N | T | Y | D | N | T | L | L | Y | T | D | Y | L | L | S | E | I | I | K | L | L | K | E | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | G | G | G | S | S | G | G | G | S | S | S | S | G | G | G | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | S | Y | E | S | S | L | F | Y | L | S | D | H | G | E | S | L | G | E | N | G | I | Y | L | H | G | M | P | Y | A | I | A | P | S | Y | Q | T | H | I | P | A | I | F | W | S | N | D | E | K | L | M | N | L | A | K | E | H | K | G | L | K | L | S | Q | D | N | L | F | S | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | L | L | G | Y | F | N | V | K | T | S | V | Y | E | P | E | Y | D | L | L | N | P | K | L | K | A | N | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | G | G | G | T | T | S | T | T |
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