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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4s3lA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: major pilin protein; | PDBTitle: crystal structure of major pilin protein pitb from type ii pilus of2 streptococcus pneumoniae |
Added to library: Sat Aug 1 08:22:55 2015 | |
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Sequence | D | D | N | S | A | I | T | K | A | N | G | E | N | N | A | V | V | K | I | N | K | T | L | N | I | A | E | G | I | T | T | P | T | A | T | F | T | F | K | F | T | E | K | T | G | Q | S | S | N | G | A | P | Y | Q | T | G | V | A | I | P | D | R | N | V | E | Y | N | K | N | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | S | T | T | S | T | T | B | T | T | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | P | T | A | D | K | I | Q | K | A | T | E | D | I | F | S | G | V | A | Y | G | H | A | G | E | Y | V | Y | D | V | A | E | A | K | T | G | W | Q | A | I | T | K | N | G | K | T | I | D | A | M | R | Y | D | K | R | T | Y | E | M | H | V | I | V | K | N | K | V | N | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | B | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | Y | I | S | S | V | Y | F | K | E | N | N | K | S | N | A | P | K | V | E | S | S | E | Q | G | V | Y | N | L | F | D | N | T | Y | T | K | D | A | S | K | E | P | N | P | D | D | P | S | Q | V | D | P | N | A | K | A | L | T | I | T | K | K | V | D | G | A | S | G | D | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | S | B | T | T | B | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | R | D | F | Q | F | H | I | K | I | Q | L | P | S | T | N | K | T | A | E | T | P | V | T | N | I | I | V | K | H | G | S | K | S | E | V | L | A | V | V | T | P | A | D | T | V | E | Y | N | F | T | L | K | D | G | E | T | F | T | V | E | Q | L | P | A | G | S | K | Y | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | G | S | S | S | S | T | T | B | T | T | T | T | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | V | T | E | T | G | V | A | G | Y | T | D | S | S | I | Y | T | T | N | G | A | E | Q | T | S | Q | G | Q | K | N | V | D | F | T | L | T | D | I | L | I | G | E | K | K | N | D | N | K | V | T | N | K | I | D | D | V | T | P | T | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S |
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