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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4s0uC_ | 2.35 | PDB header: immune system | Chain: C: PDB Molecule: retinoic acid early transcript 1l protein; |
Added to library: Sat Apr 23 10:00:10 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | P | H | S | L | S | Y | D | I | T | V | I | P | K | F | R | P | G | P | R | W | C | A | V | Q | G | Q | V | D | E | K | T | F | L | H | Y | D | C | G | N | K | T | V | T | P | V | S | P | L | G | K | K | L | N | V | T | M | A | W | K | A | Q | N | P | V | L | R | E | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | I | L | T | E | Q | L | L | D | I | Q | L | E | N | Y | T | P | K | E | P | L | T | L | Q | A | R | M | S | C | E | Q | K | A | E | G | H | S | S | G | S | W | Q | F | S | I | D | G | Q | T | F | L | L | F | D | S | E | K | R | M | W | T | T | V | H | P | G | A | R | K | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||
Sequence | K | E | K | W | E | N | D | K | D | V | A | M | S | F | H | Y | I | S | M | G | D | C | I | G | W | L | E | D | F | L | M | G | M | D | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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