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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rz9A_ | PDB header: rna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: pre-mrna-splicing factor 38a; | PDBTitle: pre-mrna-splicing factor 38a as 1-179 |
Added to library: Sat Dec 5 08:15:00 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | A | N | R | T | V | K | D | A | H | S | I | H | G | T | N | P | Q | Y | L | V | E | K | I | I | R | T | R | I | Y | E | S | K | Y | W | K | E | E | C | F | G | L | T | A | E | L | V | V | D | K | A | M | E | L | R | F | V | G | G | V | Y | G | G | N | I | K | P | T | P | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | T | T | B | G | G | G | G | S | T | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | C | L | T | L | K | M | L | Q | I | Q | P | E | K | D | I | I | V | E | F | I | K | N | E | D | F | K | Y | V | R | M | L | G | A | L | Y | M | R | L | T | G | T | A | I | D | C | Y | K | Y | L | E | P | L | Y | N | D | Y | R | K | I | K | S | Q | N | R | N | G | E | F | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||
Sequence | L | M | H | V | D | E | F | I | D | E | L | L | H | S | E | R | V | C | D | I | I | L | P | R | L | Q | K | R | Y | V | L | E | E | A | E | Q | L | E | P | |||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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