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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rybA_ | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 3; | PDBTitle: crystal structure of beta-ketoacyl-acp synthase iii (fabh) from2 neisseria meningitidis |
Added to library: Sat Jan 3 08:43:58 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | Y | A | K | I | S | G | T | G | S | Y | L | P | A | N | R | V | S | N | D | D | L | A | Q | K | V | D | T | S | D | E | W | I | T | A | R | T | G | I | K | F | R | H | I | A | A | E | N | E | K | T | S | D | L | A | A | E | A | A | R | R | A | L | D | A | A | G | L | D | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | E | I | D | L | I | I | V | A | T | A | T | P | D | M | Q | F | P | S | T | A | T | I | V | Q | Q | K | L | G | I | T | N | G | C | P | A | F | D | V | Q | A | V | A | G | F | M | Y | A | L | T | T | A | N | A | Y | I | K | S | G | M | A | K | N | A | L | V | I | G | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | F | S | R | I | V | D | W | N | D | R | T | T | C | V | L | F | G | D | G | A | G | A | V | V | L | S | A | A | D | K | P | G | I | I | H | S | K | L | K | A | D | G | N | Y | L | K | L | L | N | V | P | G | Q | I | A | C | G | K | V | S | G | S | P | Y | I | S | M | D | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | T | T | T | T | B | S | S | S | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | G | V | F | K | F | A | V | K | M | L | S | K | I | A | D | D | V | I | E | E | A | G | Y | T | A | A | Q | I | D | W | I | V | P | H | Q | A | N | R | R | I | I | E | S | T | A | K | H | L | G | L | S | M | D | K | V | V | L | T | V | Q | D | H | G | N | T | S | A | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | T | T | G | G | G | B | B | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||
Sequence | I | P | L | A | L | D | T | G | I | R | S | G | Q | I | K | R | G | Q | N | L | L | L | E | G | I | G | G | G | F | A | W | G | A | V | L | L | Q | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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