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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ry9A_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: periplasmic binding protein/laci transcriptional regulator; | PDBTitle: crystal structure of carbohydrate transporter solute binding protein2 veis_2079 from verminephrobacter eiseniae ef01-2, target efi-511009,3 a complex with d-talitol |
Added to library: Sat Dec 27 09:58:31 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | A | F | K | I | G | V | S | M | K | T | L | S | A | P | Y | F | A | A | Q | M | E | A | A | K | A | R | G | K | E | L | G | Y | E | V | L | A | T | D | A | Q | G | K | L | Q | K | Q | I | S | D | V | E | D | L | V | T | R | G | V | K | L | L | I | I | N | P | A | D | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | L | V | N | A | V | N | N | A | S | A | N | G | V | K | V | V | V | I | D | S | T | L | N | P | R | A | N | F | V | T | Q | V | Q | S | S | N | S | I | N | G | A | L | V | G | H | W | V | I | E | E | V | G | N | K | S | L | K | I | A | L | L | S | G | E | K | G | N | P | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | Q | E | R | R | L | G | V | L | S | G | I | I | E | A | Q | L | R | K | F | G | K | A | D | L | T | V | V | G | Q | G | W | G | H | W | N | D | E | G | G | L | K | A | M | E | D | L | L | V | A | N | K | D | I | N | M | V | L | G | E | N | D | S | M | V | L | G | A | R | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | I | E | S | A | G | R | T | G | I | L | L | V | A | A | A | D | A | Q | K | E | A | L | A | L | I | K | Q | G | K | Y | G | V | T | G | L | N | D | P | A | L | V | A | R | T | A | I | D | L | G | V | K | V | V | K | G | E | V | K | D | V | P | K | Q | T | L | T | T | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | B | T | T | S | S | B | B | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | I | T | K | G | N | V | D | K | F | Y | N | P | K | A | V | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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