|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4rxtA_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: sugar abc transporter; | PDBTitle: crystal structure of carbohydrate transporter solute binding protein2 arad_9553 from agrobacterium radiobacter, target efi-511541, in3 complex with d-arabinose |
Added to library: Sat Dec 27 09:29:37 2014 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | S | M | A | E | V | T | I | P | I | I | V | K | D | T | T | S | F | Y | W | Q | I | V | L | A | G | A | R | K | A | G | K | D | L | G | V | K | V | P | E | L | G | A | Q | A | E | T | D | V | N | G | Q | I | S | I | L | E | N | A | V | A | G | K | P | A | A | I | V | I | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | T | T | S | T | B | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | E | F | K | A | L | G | K | P | V | D | E | A | A | K | S | V | P | I | I | G | I | D | S | G | A | D | S | K | A | F | K | S | F | L | T | T | D | N | T | Q | G | G | R | I | A | A | D | G | L | A | A | A | I | K | A | M | T | G | K | E | E | G | D | V | V | I | I | T | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | P | G | A | G | S | L | E | Q | R | R | T | G | F | L | D | Q | V | K | T | K | Y | P | G | L | K | V | V | A | D | K | Y | A | D | G | Q | A | T | T | G | L | N | I | M | T | D | L | I | T | A | N | P | K | I | V | G | V | F | A | S | N | L | I | M | A | Q | G | V | G | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | I | A | E | N | K | L | S | D | K | V | K | V | I | G | F | D | S | D | D | K | T | L | G | F | L | K | S | G | A | I | A | G | L | V | V | Q | D | P | Y | R | M | G | Y | D | G | I | K | T | A | L | A | V | S | K | G | E | K | V | E | A | N | V | D | T | G | A | N | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | K | A | N | M | S | D | P | K | I | E | A | L | I | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|