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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rusD_ | PDB header: sugar binding protein | Chain: D: PDB Molecule: fish-egg lectin; | PDBTitle: carp fishelectin, holo form |
Added to library: Sat Apr 11 08:15:56 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | D | C | T | V | I | D | G | N | L | K | Q | I | D | A | G | S | G | S | V | V | G | V | N | N | L | N | E | T | F | V | L | I | D | N | V | F | T | K | I | S | G | S | L | K | H | F | S | V | G | P | A | G | Q | L | G | V | N | T | A | N | N | I | F | K | Y | Q | S | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | V | Q | L | A | G | L | L | K | Q | V | D | A | G | G | D | Q | I | I | A | G | V | N | M | Y | D | D | I | Y | C | L | N | M | D | A | N | N | K | W | P | S | S | N | T | P | W | V | Q | L | N | G | K | L | K | Y | Y | S | C | G | P | Y | S | C | W | G | V | N | S | N | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | I | F | I | M | K | D | V | S | S | N | V | C | S | G | S | G | S | F | I | N | I | P | G | L | L | S | M | I | E | V | A | T | D | G | S | V | F | G | V | N | S | Q | G | N | L | Y | Q | R | T | G | V | T | R | S | K | P | D | G | T | D | W | I | S | M | V | A | C | P | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | B | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | B | T | T | B | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||
Sequence | G | H | K | H | V | S | F | D | L | G | V | L | W | L | V | C | V | D | G | S | I | R | K | C | I | L | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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