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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ru3A_ | PDB header: cell invasion | Chain: A: PDB Molecule: puncturing protein gp41; | PDBTitle: crystal structure of the cell puncturing protein gp41 from pseudomonas2 phage sn |
Added to library: Sat Nov 21 08:17:48 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | I | A | A | L | D | A | R | S | R | R | D | A | L | D | F | E | V | M | I | P | A | Q | V | V | Q | Y | D | R | A | E | N | I | A | T | I | Q | P | L | I | T | W | V | D | T | E | H | N | A | V | Q | R | H | Q | L | V | D | I | P | V | I | S | M | G | A | G | G | F | H | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | F | P | I | Q | Q | G | D | I | G | W | I | Y | A | A | D | R | D | T | S | Q | F | L | E | S | L | S | M | S | K | P | N | T | G | R | I | H | K | F | E | H | G | L | F | I | P | D | V | F | R | R | Y | T | I | N | S | E | D | S | A | A | M | V | I | Q | S | T | S | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . |
Sequence | T | R | I | S | I | R | G | D | N | I | K | I | T | A | P | S | N | V | T | V | D | T | P | Q | A | N | F | T | G | S | V | T | I | A | N | T | L | V | V | N | G | V | N | V | N | N | H | G | H | L | E | N | N | P | P | D | A | R | T | K | G | G | M | I | A | |||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | B | T | T | T | T | T | B | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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